Questo silicato di alluminio è molto simile per struttura allo zircone; questi infatti sono dei silicati che appartengono al gruppo dei nesosilicati, cioè la loro struttura mineralogica si basa su tetraedri isolati di SiO4: ne risulta una disposizione molto compatta così che i vari minerali presentano elevati valori di rifrangenza, durezza e densità.
In figura la forma di cristallizzazione e la struttura spaziale (Carobbi, Mineralogia Speciale e Cristallografia Chimica, Ed. USES).

Cristallizza nel sistema rombico, con habitus prismatico per lo più tozzo di colore giallo bruno a rosa e rosso che possono talvolta raggiungere le grandi dimensioni (ne è stato trovato un esemplare presso Minas Gerias, Brasile, che si trova al Museo di Mineralogia dell'università di Firenze, del peso di 151 Kg), una sfaldatura basale (secondo 001) perfetta, durezza 8 nella scala di Mohs, un peso specifico di 3.40, è inattaccabile dagli acidi, la lucentezza è vitrea.
Il topazio giallo se riscaldato diventa rossastro ed è chiamato "topazio bruciato".